도쿄 에일리언즈 2 더블특장판이 출간되었다는 말을 듣고 품절이 되기전에 빠르게 구매하게 되었습니다.
AMO에 합류하고 평범한 일상생활로 돌아간 아키라는 학교에서 텐쿠바시를 만나게 됩니다.
탠쿠바시는 아키라에게 AMO로 가는 또 다른 루트를 알려주는데 길을 따라가다가 한눈판사이 그를 놓쳐버리게 됩니다. 의문의 소녀를 만나게 된 아키라는 시설로 안내를 받으며 가고있는데 갑자기 나타난 텐쿠바시가 말살 대상이라며 그녀를 공격하게 됩니다. 도망간 소녀를 뒤로하고 AMO에 도착하여 첫번째 임무로 외계인 소녀의 경호를 하게됩니다.